刘翼振副教授在自然指数期刊《Analytical Chemistry》上发表CRISPR分子诊断研究成果

作者: 发布时间: 2023-12-12 浏览次数: [ ]


小非编码RNA (Small noncoding RNA, sncRNA)是生命活动的重要调控因子,在基因表达调控、生物发育、代谢和疾病中发挥着重要作用。然而,目前许多现有检测方法对<22个核苷酸(nt)的超短sncRNA的检测特异性较差。CRISPR/Cas13a系统是一种很有前景的核酸检测技术,可在不受基因组DNA干扰的情况下直接检测sncRNA。目前的报告表明,标准CRISPR/Cas13a系统检测28 nt 靶RNA可在20分钟内迅速产生强烈的荧光信号,然而检测超短RNA时的检测性能急剧下降。

针对这一挑战,BEAT365唯一官网刘翼振副教授在国际分析化学顶级期刊、自然指数收录期刊《Analytical Chemistry》上发表了题为Foldback-crRNA-Enhanced CRISPR/Cas13a System (FCECas13a) Enables Direct Detection of Ultrashort sncRNA”的研究成果。beat365体育官网平台为独立通讯单位,已申请国家发明专利(CN116287129A)。 https://doi.org/10.1021/acs.analchem.3c02687

    

回折crRNA增强的CRISPR/Cas13a系统检测超短sncRNA

如图所示,该研究提出了一种回折crRNA增强的CRISPR/Cas13a (FCECas13a)系统,解决了现有CRISPR/Cas13a系统在检测超短sncRNA方面的局限性。对于17 nt的超短RNA, FCECas13a系统表现出了与标准的28 nt靶RNA系统相当优秀反式切割性能。本研究将这种方法用于miRNA720(17 nt)和miRNA2392(20 nt)短链的测试,证实了其不仅能检测传统CRISPR/Cas13a无法检测的超短链,而且达到了fM级的灵敏度。本研究提出的FCECas13a系统克服了长期以来直接检测超短RNA的挑战。FCECas13a系统的简单、敏感和特异性,加上其与其他检测方法的兼容性,使其成为各种临床诊断和商业应用的有力工具。

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